Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Usp38Q8BW70 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Usp38Q8BW70 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Usp38Q8BW70 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Usp38Q8BW70 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Usp38Q8BW70 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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