Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccdc18Q640L5 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms