Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpusd3Q14AI6 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpusd3Q14AI6 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms