Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms