Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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