Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms