Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3839S4R1W1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3839S4R1W1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3839S4R1W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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