Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms