Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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