Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Robo3Q9Z2I4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms