Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms