Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms