Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms