Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sumo3Q9Z172 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Sumo3Q9Z172 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sumo3Q9Z172 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms