Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms