Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp2Q9Z0Z3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms