Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms