Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xpr1Q9Z0U0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xpr1Q9Z0U0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms