Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AireQ9Z0E3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AireQ9Z0E3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AireQ9Z0E3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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