Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChrdQ9Z0E2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms