Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stxbp4Q9WV89 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stxbp4Q9WV89 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms