Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip1Q9WUU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms