Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms