Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms