Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms