Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms