Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms