Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms