Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms