Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms