Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms