Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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