Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms