Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phtf1Q9QZ09 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms