Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms