Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan3Q9QY33 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms