Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms