Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms