Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms