Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt17Q9QWL7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms