Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms