Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms