Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms