Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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