Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neu3Q9JMH7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neu3Q9JMH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neu3Q9JMH7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neu3Q9JMH7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neu3Q9JMH7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neu3Q9JMH7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neu3Q9JMH7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms