Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2bQ9JME9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms