Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms