Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cul3Q9JLV5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms