Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd2apQ9JLQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms