Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp1Q9JLK7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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